본 연구소는 “첨단과학기술을 위한 계산수학 연구 및 응용”으로 특성화 분야를 설정하고, 연구소의 강점분야인 암호학, 영상처리, 생명의료기술 통계기법 분야 연구역량을 극대화하여 국제적인 경쟁력을 갖추는데 중장기 목표를 두고 있다. 이러한 특성화 방향은 수학, 통계학 및 이론물리의 발전을 기반으로 하는 정보과학, 생명과학, 나노과학 분야와 밀접한 연계가 있다. 수리과학연구소는 이들 특성화 사업단과의 협력 및 공동연구 수행을 통하여 전체 연구 성과의 시너지를 높이고 본 사업단의 전문화를 높이기 위해서 본교 특성화 연구소로 지정될 예정이다. 이미 암호 및 정보보호, 영상처리, 생명의료기술 분야로의 응용과 연계된 다수의 교수 및 연구원들이 공동 연구를 활발히 수행 중인 본 연구소는 특성화 방향에 맞는 교수진 및 연구원들을 유치하여 연구 및 신진 인력육성의 세계적인 중심지로서 역할을 해 낼 것이다.