1945년 의과대학 개교 이후 현재까지 70여 년 동안 우수한 여성의학자와 여의사를 배출하여 왔으며, 2005년에는 21세기 정보화,세계화된 세상을 미리 준비하는 유능한 의료전문직 영성을 양성하기 위해 의학전문대학원으로 학제를 전환하여 2007년에는 의학전문대학원 첫 신입생이 입학하였다. 의학과 1개 학과로 구성되어 있으며, 12개 기초의학교실 및 23개 임상의학교실 등 총 35개 교실로 구성되어 있다. 현재 215명의 전임교수와(교수 137명,부교수 49명,조교수 29명)가 재직하고 있다.
2019년 2월 이후, 서울 마곡지구로 이화여자대학교 의과대학 마곡캠퍼스(에스더빌딩)이 이전하였다.